水虫の原因は真菌（しんきん；カビ）なので、抗真菌薬（こうしんきんやく）で治療します。

趾間型（しかんがた）、小水疱型（しょうすいほうがた）の水虫の場合は、通常は外用薬（がいようやく）を1ヵ月以上用いればよくなります。

一方、角質増殖型（かくしつぞうしょくがた）や爪白癬（つめはくせん）の場合は、外用薬では白癬菌（はくせんきん）のすみついている奥の方までは薬が届きにくいため、内服薬（ないふくやく）が処方されます。また、外用薬によるかぶれやただれがひどい場合にも、内服薬を短期間用いることがあります。